梅伊比斯和铃科百合子回到魔禁世界的时候，时间已经走到了10月30号。
在他们不在的这段时间里，整个世界风起云涌，发生了许多事情。
「神之右席」的右方之火，在得知萝拉遇袭并对外宣布修养（实际上开始研究伯利恒之星）后，通过布置在清教的内线得知了伯利恒之星的消息。加上让人忌惮的奥莱尔斯和奥帝努斯失踪，觉得时机已经成熟，于是开始了他的“让世界归位”的计划。
右方之火通过控制教皇马钉利斯，成为了罗马正教的真正“支配者”。为收集“伯利恒计划”所需要的所有物资和数据，让“必须打倒的敌人（世间的恶意）”浮出台面，并操控罗马正教和俄罗斯成教发动了第三次世界大战。
10月15日，英国清教三大势力之一的「骑士派」控制者，英国二王女凯莉莎根据当下世界的大趋势作出预判，断定在不久的将来世界将卷入一场大规模的冲突当中。
英国清教虽是十字教分支，但与罗马的正教关系一向不睦，明争暗斗，权谋诡计，双方的矛盾终有一日无法调节。而现在伯利恒之星落到清教手中，对自恃十字教正统并试图号令十字教各教系的正教形成了鲜明威胁。
未来将会演变成直接冲突。
到时，英国清教的实际领导者，「必要之恶教会」的最大主教萝拉必然寻求外力支持，与科学侧的学园都市结盟，而与此同时罗马正教必定拉拢俄罗斯成教，双方坐上同一辆战车。世界将分为两大阵营，以英国清教和学园都市为首的科学侧，以及以罗马正教、俄罗斯成教为首的魔法侧。
虽然英国清教也算魔法侧，但凯莉莎毫不怀疑，当时局发展到一定阶段的时候，萝拉必定会寻求与学园都市结盟，共同对抗罗马正教！
但是凯莉莎料定，不论最后的获胜方是英国清教和学园都市联盟，还是罗马正教以及俄罗斯成教团体，英国都会衰败。如果罗马正教胜利，英国则会马上被毁灭。而如果学园都市方胜利，魔法国家英国也会被孤立。
两种结果都是她不可接受的，为拯救英国，在10月18日，不列颠万圣之夜，凯莉莎决定发动政变控制英国，随后试图用自己的方法——将国家级术式「卡提纳」的使用权限扩大到英国本土外部，最后将罗马正教势力赶出欧洲。
10月17日，凯莉莎利用魔法结社「新生之光」发掘和运送「卡提纳·正统」仪典剑。在得到「卡提纳·正统」并获得了天使长“似神者”米迦勒之力后悍然发动政变，控制英国大部分的领土，并打算在政变成功后进军欧洲大陆。
10月18日凌晨，持「卡提纳」发动的「全次元切断术式」由于在英国清教三大势力之一的「清教派」的强制干扰下，「卡提纳·正统」陷入暴走，大约五成力量被剥夺。随后「骑士派」骑士团长战败，使得整个「骑士派」陷入动摇。
在「清教派」的反击中，「皇室派」领袖英国女王伊莉莎发动术式「联合的意义」，在「卡提尔·第二」的力量已经消失的情况下，最终由于受到茵蒂克丝使用「强制咏唱」干扰，利用凯莉莎一时间失去对「卡提尔·正统」控制的间隙，上条当麻使用「幻想杀手」将「卡提纳·正统」击碎。
政变宣告失败！
政变结束后，被分配给国民的「天使之力」重新回到「卡提纳·第二」。
……
……
10月15日，罗马正教判定上条当麻的右手有着抹杀十字教未来的风险，视上条当麻为潜在威胁，并派遣暗杀队伍斩断其右臂，或者对上条当麻进行人道毁灭。
10月17日，英国清教发布了“禁书目录召回令”，茵蒂克丝被召回协助调查欧洲隧道爆炸事件。在飞往英国的航班上一度遭到恐怖分子绑架。之后卷入了二王女凯莉莎的政变。
10月17日，为了获得禁书目录的远距控制灵装，右方之火使用罗马正教、俄罗斯成教的力量使英国孤立。并于18日二王女发动政变之际入侵英国，夺取了茵蒂克丝的远距控制灵装。
10月18日，被保管在圣乔治大教堂地下密室中的伯利恒之星失窃。
10月18日，为救被右方之火夺取了“灵装”而失去意识的茵蒂克丝，上条当麻只身前往右方之火的老巢俄罗斯。
10月18日，右方之火操纵罗马正教和俄罗斯成教发布“宣战布告”。
10月19日，学园都市「特别调查课」获知消息，全体能力者前往俄罗斯。与此同时，俄罗斯成教大肆入侵学园都市，在学园都市展开交战。
世界大战爆发。
三日后，罗马正教宣布圣战日，耶路撒冷十字军开拨，准备彻底歼灭英国清教。
五日后，法国、英国、美国、俄罗斯、德国宣布参战，黑海舰队、法国海军舰队、大西洋舰队共同朝着英国海域逼近。英国本土舰队搭载清教魔法部队迎敌。
战火瞬间爆发，主战场的硝烟在整片欧洲上空飘散，地中海、北非、西亚等地全部卷入其中。另外第二战场，学园都市与俄罗斯成教所在地，同样爆发了大规模的冲突。
伊利沙里纳独立国同盟内，伊利沙里纳对逃亡于此的莎夏·克洛伊洁芙和前方之风予以了庇护。但没多久莎夏被右方之火掳走。
10月30日，俄罗斯成教袭击学园都市宣告失败。加上梅伊比斯和铃科百合子的突然回归，成教决定撤离。
同时，时空管理局派驻魔禁世界的监察者奥莱尔斯在获得梅伊比斯授权的情况下插手，右方之火的计划败露，第三次世界大战戛然而止。随后罗马正教教皇马钉利斯重新掌权，在学园都市、罗马正教、英国清教、俄罗斯成教四方联合下，右方之火的计划受到前所未有的阻力。
10月30日，第三次世界大战终战日。上条当麻潜入巨大要塞“伯利恒之星”，在“伯利恒计划”的最后阶段，上条当麻的右手被右方之火砍断，右方之火完成“第三只手”——「神圣右方」。但上条当麻诡异的再度长出右臂，伴随人心的善念战胜恶念，「神圣右方」迅速失去力量，并被上条当麻破坏。
战斗结束后，上条当麻将救生舱让渡给右方之火，但因他曾窥见了在“幻想杀手”中隐含的“某种东西”，并导致了亚雷斯塔的计划不得不“绕远路”。远在学园都市的亚雷斯塔恼怒之余，通过量子纠缠态以虚拟的形式出现在俄罗斯，并以一招砍下右方之火的右手「神圣右方」。
失去右手的右方之火变成了普通人，被赶来的奥莱尔斯和席薇亚回收。
11月5日，第三次世界大战休整基本完成。罗马正教进行整编，教皇马钉利斯宣布退位，枢机主教彼得·尤古迪斯接任教皇之位。
同日，失踪的上条当麻奇迹般回归学园都市。
由于奥帝努斯已经前往时空管理局赴任，所以原本应该发生在11月13日的事情并没有发生。
在原著中，那一日，在已经被压制的巴格吉城，奥帝努斯在其属下「格雷姆林」的魔法师玛丽安·丝琳格奈娅被击破之际出现，顺便捏断了上条当麻的右手并粉碎了寄宿在其体内的“看不见的存在”，并回收了玛丽安。而上条当麻则应该被奥莱尔斯和右方之火回收，并接上右臂，送回学园都市。
……
……
“亚雷斯塔的算计最终还是出现了一个大漏洞。”在「特别调查课」的院子里，梅伊比斯摇着头说道。
……
英国清教那边，实际控制者萝拉·斯图亚特，优雅地喝着红茶，脸上带着淡淡的微笑。“亚雷斯塔，终归还是露出破绽了。”
第三次世界大战终战日那天，短暂现身俄罗斯雪原并一招击败了右方之火的人正是亚雷斯塔，此讯息自然被英国清教方面收集到了。而伴随着第三次世界大战后，学园都市、罗马正教、俄罗斯成教均已元气大伤，英国清教虽然也不能幸免，但是就最高的战力而言，随着奥莱尔斯和奥帝努斯的退出，唯有亚雷斯塔的学园都市以及萝拉的英国清教还有一决高下的资格。
通过对影像资料的分析，清教方面判定出了亚雷斯塔就是那个本应已死于1947年12月1日英国清教刺客之手的邪恶的魔法师。
对于这个消息，萝拉脸上并无任何惊讶的表情。
“接下来出于魔法侧的大义，该是讨伐亚雷斯塔的时候了。通过宗教审判，将学园都市和科学阵营完全收入囊中，似乎也不是不可能。”
但是想到学园都市还有一个梅伊比斯存在，她又不由摇了摇头，“真是伤脑筋啊……”
……
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—魔禁篇终—
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