三月，南京临时参议院正式发表了议决统一政府的组织办法六点∶
（一）由参议院电知袁世凯允其在北京受职；（二）袁世凯接电后即电参议院宣誓；（三）参议院接宣誓电后即电复承认受职，并通告全国；（四）袁受职后即将拟派之国务总理及各国务员姓名电达参议院征请同意；（五）国务总理及各国务员任定后，即在南京接收临时政府；（六）临时总统孙中山于交卸后始行解职。
随后，袁世凯便在北京宣誓就任临时大总统。次日，孙中山在南京颁布《中华民国临时约法》。按照临时约法，政府采用责任内阁制，总统不掌握实权，但随着南京临时政府的政权移交给北方，这份宋教仁精心炮制的内阁制约法，实际已不可能起到限制袁世凯掌握行政权力的作用了。
很快，袁世凯又提出以唐绍仪为国务总理，孙中山等人则主张由同盟会员担任这个重要职务，双方一度争持不下。最后经立宪派调解，唐绍仪出任总理，同时加入同盟会。25日，唐抵南京组织新内阁，接收临时政府。
新内阁内政、陆军、海军、外交四个重要的部都由袁世凯亲自选定的人员掌握，财政部也在拥袁的立宪派手中，同盟会员只掌握了教农林、工商等部总长，教育部则由光复会的章太炎担任总长。
但是为了结成“围剿”社会党的统一战线，袁世凯又一次显露出了他官场沉浮数十年的老辣手段，抓大放小，为了安抚同盟会，袁世凯甚至不惜放弃了原本用以讨好立宪派的“总统不党”主张，在唐绍仪加入同盟会以后，袁世凯亦通过他儿子袁克定与汪精卫之间的私人关系，向孙中山、黄兴、宋教仁等人表示了袁世凯愿意以个人身份加入同盟会的打算。
这一消息传到南京和上海，不免又引发了同盟会与立宪派群体的一片狂欢之声。就连原本对袁世凯极不信任，认为联袁远远不如联林的孙中山，这时候都觉得自己是以小人之心度君子之腹，至如宋教仁则更是以创建中国议会政治的功臣自居，每日只与立宪派士绅们唱和。
在袁世凯这样一番优容同盟会的表皮之下，则是袁世凯任命了段祺瑞取代黄兴担任陆军总长。
对陆军总长一职，南方革命军将领普遍要求由黄兴继续担任，反对任命段祺瑞，他们通电全国表示“陆军总长非中外著闻、富有才学威望者，决难维系南北军心而谋全国幸福。黄总长兴缔造民国，苦心经营，尤为全球所钦服。……现在国基未固，全国军队正在易动难静之时，再四思维，足以从容镇抚、措置裕如者，黄君而外，实难其选。”
在这个问题上，中国社会党也持相同意见，但袁世凯寸步不让，他鼓动北洋军将领以军界统一会名义致电参议院，声称如不以段祺瑞为陆军总长，则要求大总统另行组织政府。
很快袁世凯便授意张謇，让他致电黄兴说：“内阁不速成立，危险万状，其原皆在陆部一席不决。南方军队所主张，北方亦有万难。现内乱外交，均极纷逼，倘再延迟，必致不测。万不得已，仍当以克强就参谋为调和计。”
接着袁世凯又与张謇相配合，答应孙中山成立南京留守处，由黄兴任留守，统率南方各省军队，实际上不过是把遣散南方北伐军的包袱丢给了黄兴，使同盟会在遣散北伐军的过程中，不得不与一大批革命军人、地方势力关系恶化起来。
结果，又是同盟会让步，同意由段祺瑞任陆军总长，此外宋教仁原本希望掌握财政大权的努力，也因为袁世凯的坚决反对而失败，最后确定由立宪派的熊希龄担任财政总长。
袁世凯这时候甚至还向社会党伸出了橄榄枝，他在陆军部之争的同时，便提出倡议，声言准备任命林淮唐为参谋总长并统辖两江军队。
但这个消息刚刚通过报纸透露出来，同盟会系统的南方革命军将领，便纷纷通电反对，与之前社会党坚决支持黄兴任陆军总长的做法一比较，真正是截然相反。
林淮唐和党中央的代表们都还在上海，他在总工会食堂与工友们一起吃饭时，姚雨平夹带着电报纸匆匆走了进来，他看了看周围的工人们以后，便一言不发。
“什么事情？参谋总长的事情吗？没关系，这不是什么机密，士云，你直接讲吧。”
姚雨平苦笑道：“李烈钧也通电反对书记长任参谋总长了，还有黎元洪、谭延闿、蔡锷、唐继尧、陆荣廷……西南各省都督也同样通电反对，重要的政治人物里面，只有粤督廖仲恺、闽督郑祖荫通电声援，咱们现在的情势还真是孤立啊。”
“哈哈哈，荪公声援我们是意料之中的事情，没想到廖都督也声援了我们？这是意外之喜。这情势比党中央之前预计的情况，还要好呢。”
周围的工友们听着林淮唐和姚雨平的对话，许多人都在桑来朝带头下自觉识趣地走了出去。但林淮唐很快便招招手，示意大家不要离开。
林淮唐笑盈盈地看着食堂内众多工友，说道：“听说我们的袁世凯总统，刚刚透露出准备任命鄙人做参谋总长的口风，全国就有十几个都督接连发电来骂我。咱们党内许多同志看了人家的电文，很不开心，有的人还气得生了病。你们说这值得吗？这不值得。”
“听说袁总统有意我来做新内阁的参谋总长，但是这个事情即便全国那十几位都督不来骂，我也决然不会去坐那个位置。什么内阁总长，于我国民劳农群众而言，有什么帮助吗？有什么作用吗？如果让我做一个劳工总长、做一个农民总长，那还可以，但是做一个参谋总长，就完全没有必要。”
林淮唐拍着姚雨平的肩膀，说：“这件事大家不要气愤，人家既然来骂，那就是给了我们一个做讲演的好舞台。你说一个大总统、十几个都督来搭舞台，这舞台规模够不够宏大？我马上就拟电文，拒不接受任命嘛！然后我们党内，我也有一个这样的建议，就是我们党的所有主要干部，都不到新政府任职去。”
姚雨平大吃一惊：“这样的决定，恐怕反对声很大。而且我们都不担任新政府的公职，岂不是把革命以来血战所得的政权，拱手让给袁世凯吗？”
“我们不担任新政府的公职，但是可以通过自由召集的国民大会来领导地方政权嘛。”
林淮唐根本不在乎如今袁世凯和同盟会之间的种种政治表演，他很直接地说道：
“北洋或同盟会，他们那些政治表演哪怕单从表演角度来看，都落伍的很、难看的很。我们不跟他们争这个！就把自己的事情搞好，这才是最重要的。”
林淮唐又问姚雨平：“士云，听说黄克强先生出任南京留守以后，正在大力裁撤南方革命军队？说要三个月内裁军十万人？”
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